דירה שלא רשומה במחלקת ההנדסה

קניתי דירה בנתניה ליפני שנתיים מאבא שלי מדובר בדירה שכניראה ליפני 30 שנה היוותה מחסן והקבלן הפך אותה לדירה קיבלתי נסח טאבו והוצאתי תוכניות מרשם המקרקעין עם שרטוטים של הדירה והכל היה חוקי ועבר על שמי בטאבו.
ליפני כשנה כאשר רציתי להרחיב את הדירה וניגשתי למחלקת הנדסה גיליתי להפתעתי שהדירה ניבנתה ללא היתרים בהנדסה והיו קנסות מרובים אשר כולם כבר שולמו בעבר ע"י הקבלן או האדם שמכר לאבא שלי את הדירה ואין קנסות נוספים לשלם. בנוסף ישנו פס"ד של בית המשפט שמאשר את הדירה ולכן כתוצאה מכך הדירה נירשמה בטאבו.
מה המשמעות של התגלית הזו? שהרי הבניה הלא חוקית כבר ניתגלתה בעבר ושומו הקנסות והתביעה נסגרה בפס"ד שמאשר את הדירה בטאבו. הדירה רשומה על שמי בטאבו ומוצמדת לה חניה בטאבו ובשרטוטים יש שרטוט של קומת הקרקע והחניה המוצמדת והכל מאושר.
כשפניתי להנדסה אמרו לי שלי אין בעיה כי כל הקנסות כבר שומו אך הדירה לא מאושרת בהנדסה? האם תיהיה לי בעיה למכור את הדירה? האם יש סכנה לתביעות עתידיות? האם ערך הדירה יורד אם בטאבט זאת דירה ובהנדסה זה מחסן?