כיצד מחושב המע"מ על מכירת רכב פרטי משומש?

בעל מוסך החליט להיכנס לתחום של רכישה ומכירת רכב מושמש ( הצפי מספר קטן של עסקאות במהלך השנה-נניח בין 10- ל 20 עסקאות) . ההתקשרות היא לרוב אם אנשים פרטיים ( הן הרכישה והן המכירה) , המוסך יש כמובן עובדים, כמו כן לפעמים הרכב זוכה להשבחה עם חלפים שנרכשו עבורו.
כמו כן יש את סעיף 5 לחוק מעמ ותקנה 2 במע"מ שאומרת שהמע"מ יחול על ההפרש בין מחיר הרכישה לבין מחיר המכירה.
לצורך דוגמא נניח :
הרכב נרכש ב 30,000 ש"ח
הרכב נמכר ב 40,000 ₪
הושקעו ברכב עבודות פחחות בסך 1,000 ₪ , חלפים 2,000 ₪ ( מחיר עלות לא מע"מ) ושעות עבודה פועלים בסך 2,000 ₪.
ומכאן השאלות:
1. האם המע"מ יחול על ההפרש בין מחיר המכירה לבין מחיר הרכישה, ללא העלויות הנלוות, או שהמע"מ יחול על ההפרש בין מחיר המכירה לבין העלות כולל כל העלויות שהשביחו את הנכס ( כלומר להעמיס את העלויות ע"ג הרכב)?


2. על איזה סכום מופקת חשבונית המס, על ההפרש או על סכום המכירה
היות ואני מנהלת חשבונות - השאלה חשובה עבורי.
תודה לעונים