כיצד מחושבים ימי חופשה ופיצויי פיטורין לעובד במשרה חלקית?

שלום,


עבדתי 4 שנים בחברה במשרה חלקית (רק בשבתות וחגים). ההסכם עם המעסיק היה שאני מקבל סכום קבוע מראש לכל שבת שאני מגיע (העבודה היא שישי בערב עד שבת בערב). 
בתלושים החודשיים שקיבלתי המעסיק היה מגיע לסכום הקבוע אותו סיכמנו באמצעות חישוב של שעות (של שכר מינימום) + שעות נוספות. ללא סעיף החזרי נסיעות.
לאחר שסיימתי את העבודה ראיתי גם דברים שלא ציפיתי להם מבחינת הפיצויי פיטורין והפדיון ימי חופשה:
1. ימי החופשה חושבו באופן חלקי כאחוז המשרה שעבדתי (כלומר קיבלתי הרבה פחות מ12 ימי חופשה למשרה מלאה המעוגנים בחוק), אך גם התשלום עבור כל יום חופש היה סכום שכר של 3 חודשים חלקי 90. האם הגיוני גם לחשב את כמות הימי חחופשה באופן חלקי וגם אח"כ התשלום עבור כל יום חופש בצורה חלקית? ההגיון אומר שכל יום חופש צריך להיות שווה לסכום אותו הייתי מרוויח אילו הייתי עובד.
2. פיצויי הפיטורין חושבו בהתאם לשכר הבסיס ללא השעות הנוספות (שהיוו חצי מהשכר הקבוע אותו הייתי מקבל), האם הגיוני לחתוך בחצי את פיצויי הפיטורין על אף שההסכם בינינו היה סכום קבוע מראש לכל יום עבודה ורק בתלוש המעסיק חישב את הסכום באמצעות שעות עבודה?
3. לא שולמו הוצאות נסיעה בכלל בכל השנות עבודה שלי שם (על אף שבתלושים השכר היה מחושב על פי שכר מינימום). האם תקין?


אודה לעזרתכם.
תודה מראש.