האם המעסיק יכול לדרוש חוב לאחר שהיתרה נמסרה על ידי המנהלת?

שלום,
לפני כחודש הודעתי על התפטרותי ממקום העבודה והחלטתי לנצל את יתרת ימי החופש שלי במהלך 30 הימים שלאחר ההודעה המוקדמת.
יתרת ימי החופשה שנזקפים לרשותי אינה מוצגת בתלוש המשכורת שניתן לי ממקום העבודה וכששאלתי את המנהלת הישירה שלי היכן ניתן לראות את היתרה היא הסבירה לי שזו היתרה שמוצגת בדוח נוכחות (דוח פנימי שאינו מצורף לתלוש המשכורת).
לאחר שניצלתי כ10 ימים מתוך 13 הימים שעמדו לרשותי כפי שהוצג בדוח נוכחות (החופש אושר לי על ידי המנהלת הישירה והעקיפה), התקשרו אליי ממחלקת משאבי אנוש והסבירו שהיתרה שמוצגת בדוח נוכחות אינה מעודכנת, שאין לי ימי חופש לניצול ועל כן הצטבר לי חוב למקום העבודה ע"ס כ- 5000 ש"ח.
האם מוצדק מבחינתם לדרוש את החוב לאחר שיתרת ימי החופש נמסרה לי על ידי המנהלת הישירה, היציאה לחופש הייתה באישורה ובאישור המנהלת העקיפה ובייחוד כאשר היתרה אינה משוקפת על ידי מקום העבודה בתלוש המשכורת אלא רק בדוח הנוכחות האמור?
תודה